Ressources

Documents et initiatives sur la pratique de R en SHS

R Workflow

R Workflow for Reproducible Data Analysis and Reporting

Document computationnel avec R

Pour le partage et la reproductibilité de ses analyses

Rdatasets

Collection of 2264 datasets available in R

Rencontres R 2023

Conférence R francophone

L'écosystème spatiale de R

Keynote speech aux Rencontres R 2023

Building reproducible analytical pipelines with R

How using a few ideas from software engineering can help data scientists, analysts and researchers write reliable code

echarts4r

Create Interactive Graphs with ‘Echarts JavaScript’ Version 5

Analyse de réseau avec igraph

Introduction à l’analyse de réseau avec R
Cette fiche présente une méthode de caractérisation des formes du relief à l’échelle de bassins-versants qui repose sur l’algorithme geomorphons

R for Non-Programmers - A Guide for Social Scientists

This book provides a helpful resource for anyone looking to use R for their research projects, regardless of their level of programming or statistical analysis experience

Glitter makes SPARQL, un package R pour explorer et collecter des données du web sémantique

Séminaire RUSS - Séance du 7 avril 2023

Tutoriel d’analyse de séquences

Tutoriel conçu pour accompagner le manuel L’analyse statistique des trajectoires. Typologies de séquences et autres approches.

Awesome Quarto

A curated list of Quarto talks, tools, examples & articles

Cartographie et analyse spatiale de traces Strava/garmin

Exploration de traces GPS à partir de fichiers .fit

Représentation graphique avec R

ggplot2 et la grammaire graphique

Travel time calculation with R and data visualization with Observable

Application to artifical climbing walls in Paris and its neighbourhood

Mapping and spatial analyses in R for One Health studies

Training designed for people interested in using R for mapping and spatial analysis for applications in the various fields related to “one health” approaches

ElementR

Groupe d’utilisateur·rices pour le traitement de l’information géographique avec R

Quarto

0pen-source scientific and technical publishing system built on Pandoc

Get Started with Quarto

This workshop is designed for those who have no or little prior experience with Quarto

R-universe

The R-universe platform is a new umbrella project under which we experiment with various new ideas for improving publication and discovery of research software in R

R-Ladies Paris

Groupe d’utilisatrices R de Paris

Travailler avec R

Introduction à R, R Markdown, Shiny, la création de packages et l’utilisation de GitHub avec RStudio

Data Science - A first introduction

This is the website for the book “Data Science - A First Introduction”. You can read the web version of the book on this site

Stata2R

Website for Stata users who are interested in learning R

robservable

This package allows the use of Observable notebooks (or parts of them) as htmlwidgets in R

Interactive dashboards without Shiny

Presentation of alternatives to Shiny to produce interactive dashboards

Formation R avancée

Outils de développement et de performance

Cours R de Master en Statistique & Econométrie

Supports et exercices utilisés pour des Masters de Statistique & Econométrie, et Data science for social sciences à l’université Toulouse Capitole

How to manage code and data for open science (and yourself)

Good practices for building a R project
Support de présentation du projet Rzine utilisé aux Journées Annuelles du réseau MATE-SHS 2022

RMarkdown - reproducible reporting

A complete presentation of how Rmarkdown works and what it can do

Covid-19 - dataviz et vulgarisation

Séminaire RUSS - Séance du 1er avril 2022

R Screencasts

List of real-world examples of data analyses and visualization, provided with codes, datasets and the workshops recordings

miniCRAN

Create a mini version of CRAN containing only selected packages

Géomatique avec R

Ce manuel est aussi bien destiné aux utilisateurs de R souhaitant réaliser des traitements de l’information géographique, qu’aux utilisateurs de SIG souhaitant se …

glitter

This package aims at writing and sending SPARQL queries without any knowledge of the SPARQL language syntax

Bayes Rules !

This book empowers readers to weave Bayesian approaches into an everyday modern practice of statistics and data science

TSAR - Topological Study of Archaeological Refitting (JAS paper)

Methods to analyse fragmented objects in archaeology using refitting relationships between fragments scattered in archaeological spatial units (e.g. stratigraphic layers)

How to Cite R and R Packages

A short primer on how to cite R and R packages to support developers and ensure repeatable science

Greed - Bayesian greedy clustering

The greed packages enables model based clustering of networks, matrices of count data and much more with different types of generative models

Supervised Machine Learning for Text Analysis in R

This book focuses on supervised or predictive modeling for text, using text data to make predictions about the world around us
Analyse sur la concentration de l’emploi dans les communes de la métropole du Grand Paris, qui montre l’usage des fonctions du package MTA (Multiscalar Territorial …
Ce document montre comment réaliser cette carte de discontinuités en 2,5D (fausse 3D) joliment mise en page entièrement dans le langage R

giscoR

An API package that helps to retrieve data from Eurostat - GISCO

Data Visualization with R

This book helps you create the most popular visualizations

Travail collaboratif avec R

Supports associés à la formation de l’INSEE intitulée Travail collaboratif avec R.

ComplexHeatmap Complete Reference

This book gives comprehensive overviews of heatmap visualization in R by using the ComplexHeatmap package

aRchéologie - Les usages disciplinaires de R

Entre recours génériques et développement de packages spécifiques, un état des lieux en archéologie (RR2021)

S'il-vous-plaît... dessine-moi un projet

Keynote speech aux Rencontres R 2021

Stratégies Numériques en Sciences Sociales

Cours et tutoriels proposés par l’axe sciences sociales computationnelles du CREST-CNRS

Introduction to Data Science

Data Analysis and Prediction Algorithms with R

École thématique SIGR2021

Site web de l’école SIGR2021 sur les “Sciences de l’information géographique reproductibles”

Image processing and all things raster

A workshop on image processing and raster analysis at thematic school SIGR2021

Analyse d’images raster (et télédétection)

Support d’un cours réalisé dans le cadre de l’école SIGR2021

shinysurveys

Package for creating and deploying surveys in Shiny

Atelier d'analyse spatiale (GWR)

Support d’un atelier réalisé dans le cadre de l’école SIGR2021

GIS and mapping (Part 2)

Second part of a workshop on GIS and mapping with R at thematic school SIGR2021

GIS and mapping (Part 1)

First part of a workshop on GIS and mapping with R at thematic school SIGR2021

GIS and mapping (Introduction)

A lecture on the GIS and mapping ecosystem of R. Communication for the thematic school SIGR2021

Introduction à Git

Support d’un atelier réalisé dans le cadre de l’école SIGR2021

Présentez vos travaux en Markdown avec Xaringan

Support d’un atelier réalisé dans le cadre de l’école SIGR2021

Produire des documents reproductibles avec R Markdown

Support d’un atelier réalisé dans le cadre de l’école SIGR2021
Cette fiche vise à présenter une méthode efficace et simple pour réaliser, analyser et représenter des corrélations avec R, de la mise en forme des données à la …
Cette fiche rend compte d’une série de traitements permettant d’explorer la base de données MERIMEE qui consigne l’ensemble des bâtiments classés aux monuments …

Advanced R topics

Slides and other materials for all 10 working sessions

Visualizing distributions with Raincloud plots with ggplot2

How to plot different version of violin–boxplot combinations and raincloud plots with the {ggplot2} package

Analysis of Prehistoric Iconography - R package iconr

Modeling Prehistoric iconography with the iconr package

The Epidemiologist R Handbook

A bookdown for applied epidemiology and public health with R

Best Coding Practices for R

A manual of best practices to use for R

R Charts (& R Coder)

In this site you will find tutorials and code examples to start learning R and R graphs made with base R graphics, ggplot2…

The GT cookbook

This cookbook attempts to walk through many of the advanced applications for gt, and provide useful commentary around the use of the various gt functions

sfnetworks

Package for analysis of geospatial networks. It connects the functionalities of the tidygraph package for network analysis and the sf package

Calibrer des âges radiocarbone avec R

Cette leçon vous apprend à calibrer des âges radiocarbone avec R. Elle explique pas à pas comment réaliser la calibration d’un ensemble de dates et comment explorer et …

SQL in rmarkdown

Mix SQL and R code chunks in a .Rmd file to leverage our knowledge in both languages

Reproducible science workshop

One-day workshop with R and RStudio

Simplifying geospatial features

Simplifying geospatial features in R with sf and rmapshaper

Exploring the E-road network

Have a look at a graph representation of the E-road network that involves major roads in Europe and parts of central Asia.

xaringanExtra

xaringanExtra is a playground of enhancements and extensions for xaringan slides

Using the flextable R package

User documentation for the flextable package, which provides a framework for easily create tables for reporting and publications

Geospatial Network Visualization

How to visualize spatial networks created with sfnetworks using ggraph

All things R Spatial

Work in progress - An introduction to spatial R for ArcGIS users

Outstanding User Interfaces with Shiny

Book under active development - Manipulate Shiny tags, Harness the power of CSS and JavaScript, import and convert existing web frameworks…

Remote Sensing with terra

Short introduction to satellite data analysis with R

Introduction à R pour les chatons

Rédaction en cours - Ce livre s’adresse à toute personne qui n’a jamais fait de programmation et qui désire apprendre les bases du langage R

Wikidata and Correspondence Archives

How Wikidata can add some value to populate a sparse correspondence dataset with basic metadata

A quick flight to the edge of the tidyverse

Tutorial created for the February 2021 joint R-Ladies Tunis and R-Ladies Saudi Arabia (Dammam) workshop

JavaScript for R

Enhance your data science products with JavaScript [Under development]

Public Policy Analytics

Code & Context for Data Science in Government

Spatial Modelling for Data Scientists

Manual to learn how to analyse and model different types of spatial data as well as gaining an understanding of the various challenges arising from manipulating such data

Modern Statistics with R

From wrangling and exploring data to inference and predictive modelling

R Installation Guide

This resource provides step-by-step descriptions on how to install and run RStudio for Spatial Modelling for Data Scientists from your own computer

Spatially constrained clustering and regionalization

Implementation of the SKATER algorithm

Être un•e utilisateur•rice de R résilient•e

Séminaire RUSS - Séance du 5 février 2021

afrimapr intro to spatial data

Interactive learnr tutorials to introduce spatial data types, the packages sf, tmap and raster, with data from afrilearndata. Also available by using afrilearnr package

A crash course in mapping with African data

Interactive learnr tutorial which presents a gallery of plots using tmap, ggplot2 & mapview. Also available by using afrilearnr package

Join (spreadsheet) to spatial data

A step by step interactive learnr tutorial which presents how to create a map from a spreadsheet of summary data by region. Also available by using afrilearnr package

Wrangling penguins - some basic data wrangling in R with dplyr

A learnr tutorial to introduce some common functions in dplyr, part of the tidyverse.

Text mining with tidy data principles

Interactive tutorial with exercices about text mining with tidytext

Getting the most out of text

Using supervised and unsupervised approaches in NLP (R-Ladies Tunis)

An Introduction to R

The aim of this book is to introduce you to using R, a powerful and flexible interactive environment for statistical computing and research

Concevoir d’efficaces tutoriels R interactifs avec learnr (1/2)

Appréhender de façon graduée le codage dans R, voilà ce que permettent les tutoriels interactifs learnr. ils mixent exposés, exemples commentés et exercices pratiques

Peaufiner ses tutoriels R avec learnr et gradethis (2/2)

Comment tirer parti des dernières fonctionalités de learnr et gradethis pour optimiser les feedbacks, varier les widgets, styler et publier (iframe ou page autonome)

Beyond Multiple Linear Regression

Applied Generalized Linear Models and Multilevel Models in R

Data Science for Psychologists

This book provides an introduction to data science that is tailored to the needs of psychologists, but is also suitable for students of the humanities and other social …

Print Personalized Street Maps Using R

A code walk-through of how to generate streets maps in R using {osmdata} and {sf} packages

Introduction to Spatial Data Programming with R

This book contains the materials of course named Introduction to Spatial Data Programming with R, given at Ben-Gurion University of the Negev

R for Health Data Science

Statistics and data visualization applied to Health Data Science

Modern Data Science with R (2nd edition)

This is the online version of the 2nd edition of Modern Data Science with R

Introduction à la modélisation statistique bayésienne

L’objectif de cette formation est de vous faire découvrir la modélisation statistique bayésienne.

renv

The renv package helps you create reproducible environments for your R projects

R for Excel Users

This course is for Excel users who want to add or integrate R and RStudio into their existing data analysis toolkit

PsyTeachR

This website contains our open materials (books, tutorial, video…) for teaching reproducible research.

Twitter for R programmers

The aim of this book is to give people a basic introduction to Twitter, that allows to take the real-time pulse of the community R

rspatialdata

Collection of data sources and tutorials on visualising spatial data using R

easystats

Collection of R packages, which aims to provide a unifying and consistent framework for statistics and models

HTTP testing in R

Central reference for developers of R packages accessing web resources, to help them have a faster and more robust development

The lapply() family

Blog post to understand the apply functions

Analyse de données avec R

Séminaire RUSS - Contextualisation et présentation de R et Rstudio

Introduction à R

Séminaire RUSS - Base du langage, packages, Rstudio et documentation

Vers une chaine de traitement reproductible

Séminaire RUSS - Exemple appliqué d’une chaîne de traitement complète et reproductible

Engineering Production-Grade Shiny Apps

This book is about the process of building an application that will later be sent to production.

Circular visualization in R

This is the documentation of the circlize package

Writing reproducible research papers with R Markdown

Two-Day Workshop will introduce participants to the fundamentals and applications of R Markdown

Writing dynamic and reproducible documents

An introduction to R Markdown

Introduction to the Tidyverse

How to be a tidy data scientist

Introduction au tidyverse, avec game of throne

Exercices pratiques d’introduction à R et au tidyverse en explorant les données de la série Game of throne produites par Jeffrey Lancaster

R-Ladies Meetups Materials

Shiny app that lists R-Ladies websites, GithUb repositories and material used during R-Ladies meetups

Sharing Your Work with xaringan

An Introduction to xaringan for Presentations - The Basics and Beyond

GIS and mapping in R

Introduction to the sf package

ggplot2

This is the on-line version of work-in-progress 3rd edition of ggplot2 - elegant graphics for data analysis published by Springer.

Data Science in Education Using R

Essential resource for education professionals and researchers looking to increase their data analysis skills as part of their professional and academic development

reticulate

This package provides a comprehensive set of tools for interoperability between Python and R

Supervised machine learning case studies in R

A Free, Interactive Course Using Tidy Tools

De long en large ou de large en long ? Transposons facile avec R et le pivot

Présentation détaillée de pivot_longer/pivot_wider à partir de jeux de données Insee. L’intérêt de passer d’une structure large à une structure longue pour …

Introduction à ggplot2

Atelier d’initiation à la représentation graphique avec ggplot2, réalisé dans le cadre de l’école thématique Explo-shs (Mate-shs)

Mastering Shiny

Online version of a book currently under early development and intended for a late 2020 release by O’Reilly Media.

Créer son site web avec RStudio, blogdown, github et netlify

Comment créer son site web en moins d’une heure avec RStudio et le package blogdown

Introduction to Econometrics with R

This manual is described as an interactive script in the style of a reproducible research report

Notes de cours de R

Ce document (seconde version) a pour but l’initiation à R afin d’être capable de s’en servir de manière efficace et autonome.

RMarkdown for Scientists

This is a book on rmarkdown, aimed for scientists. It was initially developed as a 3 hour workshop, but is now developed into a resource that will grow and change over …

Get the full power of GitLab CI for your bookdown project

Host and deploy a bookdown on GitLab

Héberger une application Shiny sur le serveur shinyapps.io

Petit tutoriel qui présente comment héberger une application Shiny sur le serveur shinyapps.io, et comment utiliser ses propres fichiers au travers de …

R Markdown Cookbook

Book designed to provide a range of examples on how to extend the functionality of your R Markdown documents

rayshader

Create Maps and Visualize Data in 2D and 3D

Easy Flipbook Recipes with {flipbookr} and {xaringan}

These slides are aimed at helping you get started making flipbooks with {flipbookr} and {xaringan}

Reprex, ou comment demander de l’aide efficacement

Billet issu du blog ThinkR, pour construire un exemple reproductible et solutionner son problème avec l’aide de la communauté.

R Lille

Groupe d’utilisateur⸱rice⸱s R de Lille et sa périphérie

The lidR package

Hands on descriptions and tutorials for using lidR, a package for manipulating and visualizating airborne laser scanning data with an emphasis on forestry application.

Apprendre le langage R

Adaptation en français des tutoriels interactifs « Primers » de Rstudio

learnR4free

All sorts of resources (books, videos, interactive websites, papers) to learn R in english, spanish and turkish. Some of the resources are beginner-friendly and start …

Congressional data in R

A comprehensive guide to working with Congressional data (US)

Rstudio Primers

Learn data science basics with the interactive tutorials

Using R for Introductory Econometrics

This book introduces R with a focus on the implementation of standard tools and methods used in econometrics.

Exploring missing values in naniar

Learnr tutorial to expore and visualize NA data

explor

An R package to allow interactive exploration of multivariate analysis results

Aide à l'utilisation de R

Guide à l’utilisation de R (prise en main, graphiques, statistiques, application) réalisé par des enseignants de l’université de Bordeaux

Building Shiny apps

This tutorial is a hands-on activity complement to a set of presentation slides for learning how to build Shiny apps.

MigrExploreR

This application is part of a set of tools called “MigrExplorer” that allow to visualize international migrations in various aspects

Chaîne YouTube de Lise Vaudor

Tutoriels vidéos francophones d’initiation à R

rOpenSci Packages

This book is a guide for authors, maintainers, reviewers and editors of rOpenSci… and more !

Visualiser une analyse géométrique des données

Réaliser des graphiques et des tableaux statistiques permettant de visualiser et présenter les résultats d’une analyse géométrique

Installer R et RStudio (presque !) sans peine

Tutoriel à destination de toutes celles et ceux qui souhaitent installer ou réinstaller R, RStudio et les packages de base pour les sciences sociales

Why R? Webinars

Webinars organised by a team of R enthusiasts from both business and academia who aim to support local R communities around the world

Les données spatiales avec R

Module 7 « Analyse spatiale ». Lire, écrire, manipuler et représenter des données spatiales. Formations R aux MTES & MCTRCT.

Spyrales

Une communauté d’agents de l’Etat pour s’entraider en R et Python

Pretty street maps in R with the osmdata package

This tutorial is going to demonstrate how to make gorgeous maps of cities using streets and other geographic features

RSelenium Tutorial

An introduction to RSelenium for webscraping

Aprender R

iniciación y perfeccionamiento

Introduction à la statistique avec R

MOOC proposé par l’université Paris-Saclay

Spatial Data Science with R

Spatial data analysis and modeling with raster and terra package

A ggplot2 grammar guide

Explaining the grammar of graphics visualization philosophy and using ggplot2 and flipbookr

Shiny from Rstudio

Official shiny website (Tutorials, gallery and articles)

Afrimapr project

Creating R building blocks and learning resources for making data-driven maps in Africa.

Interactive web-based data visualization with R, plotly, and shiny

Create interactive and dynamic web graphics for data analysis from R

Quantitative Politics with R

This book aim to provide an easily accessible introduction to R for the collection, study and presentation of different types of political data

Geospatial Health Data - Modeling and Visualization with R-INLA and Shiny

This book describes spatial and spatio-temporal statistical methods and visualization techniques to analyze georeferenced health data in R

Le logiciel R - Une (rapide) présentation

Journée de la donnée 2019 - Commissariat général au développement durable

R packages to download open spatial data

Materials based on the book Geospatial Health Data

Module R’Stat1

Formation IRD - Analyse de variance et modélisation linéaire

learnr

The learnr package makes it easy to turn any R Markdown document into an interactive tutorial

Valoriser ses données avec R

Module 5 « Datavisualisation - produire des graphiques, des cartes et des tableaux ». Formations R aux MTES & MCTRCT.

Préparer ses données avec R et le Tidyverse

Module 2 « Préparation des données ». Formations R aux MTES & MCTRCT.

Mastering spark with R

In this book you will learn how to use Apache Spark with R

Découvrir R et RStudio

Module 1 « Premier programme en R ». Formations R aux MTES & MCTRCT.

Creating an ‘Academic Themed’ website with blogdown and Hugo

A companion guide to Dan Quintana’s thread

Statistiques descriptives

Module 3 « Statistiques descriptives ». Formations R aux MTES & MCTRCT.

Analyse des données multi-dimensionnelles

Module 4 « Exploration avancée de données ». Formations R aux MTES & MCTRCT.

Data wrangling, exploration, and analysis with R (STAT 545)

This site is about everything that comes up during data analysis except for statistical modelling and inference

rstudio4edu

A Handbook for Teaching and Learning with R and RStudio

Parcours R

Formations R pour les agents des MTES & MCTRCT

esquisse

This addin allows you to interactively explore your data by visualizing it with the ggplot2 package

Modern R with the tidyverse

Learn to use R, the tidyverse collection of packages and functional programming concepts to write efficient and readable code

ggplot2tor

Handmade tutorials to help you master ggplot2

Les données spatiales avec R

Support d’enseignement du master Mégadonnées et Analyse sociale (CNAM)

L’analyse de réseaux bipartites

Support de formation d’initiation à l’analyse de réseaux bipartites utilisé pour une école d’été organisée par le GDR ARSHS, à Nice en Juillet 2019.

Headless Chrome Automation with R

Talk slides about the crrri package - useR!2019

Introduction à l'analyse de réseau avec R

Support de formation d’initiation à R et à l’analyse de réseau (igraph) utilisé pour une école d’été organisée par le GDR ARSHS, à Nice en Juillet 2019.

Network visualization with R

Reference tutorial on static and dynamic network visualization. Continuously updated and developed

Accessibilité et données OpenStreetMap

Atelier pratique portant sur la mesure d’accessibilité à partir de données OSpenStreetMap

Reproductible Corporate Publications with R

The pagedown package (talk slides)

analyse-R

Introduction à l’analyse d’enquêtes avec R et RStudio.

Sur la détection de communautés en général et avec R en particulier

Détection de communautés avec le package igraph

Building Web Applications with Shiny and SQL Server

This book supplements my presentation at the Omaha R User Group on Thursday, April 4, 2019. If you develop Shiny Applications and your back end is a relational database, …

Geocomputation with R

Reference book on geographic data analysis, visualization and modeling.

DataExplorer

This R package aims to automate most of data handling and visualization

Iniciación a R

Curso de introducción a R, realizado en el marco del Laboratorio Mixto Internacional BIO_INCA